眼科诊疗细分为视网膜和玻璃体，葡萄膜炎，青光眼，角膜和视力矫正手术，斜视和小儿眼科等，进行专业的诊疗。特殊门诊所设有激光门诊，视力矫正门诊和斜视门诊。

本院引入了各种先进的诊断测试设备，在2008年12月引入了韩国第一台荧光素眼底血管造影设备与第四代光学相干断层扫描仪结合的最新视网膜诊断设备Spectralis。为糖尿病性视网膜病变等多种视网膜疾病的诊断，治疗方法的决定以及诊疗结果的判定提供了重要的信息。

在眼科学相关研究中，本院专家持续于国内外学会和学术期刊发表最新见解和研究结果。此外，本院有两位专家是世界最领先的视网膜专业医师学会“美国黄斑学会”的正式会员。

“美国黄斑学会”在世界范围内只有不到400名会员，韩国的正式会员更是屈指可数。建国大学医院眼科致力于提供韩国最高水平的诊疗和治疗。